Dentro del Programa de Fauna Íctica dependiente del Sector de Medio Ambiente, se desarrollan diferentes actividades entre las que se destacan:

• La Estación de piscicultura de San Cosme y San Damián, para producción de alevines de peces nativos del río Paraná.
• La Estación de piscicultura de Ayolas, para la producción de alevines de especies exóticas (Tilapias).
• El Monitoreo de la Fauna Íctica del río Paraná y arroyos tributarios, para el estudio de la composición de la Ictiofauna en la zona de influencia de la represa de Yacyretá.
• Laboratorio de Ictiologia e ictiopatologia.

     1- Estación de piscicultura de San Cosme y San Damián

• Objetivo general
-Lograr la reproducción artificial de peces nativos del río Paraná como: el pacú, la boga, el surubí, el dorado, y otras especies, para fortalecimiento de la fauna íctica y fomento de la piscicultura en el área de influencia de la represa de Yacyretá.

• Objetivos específicos
-Profundizar conocimientos sobre la reproducción inducida de las especies autóctonas del río Paraná.
-Mantener un plantel adecuado de peces reproductores adaptados al cautiverio.
-Probar diferentes tipos de producción en (estanques, tanques redes, alto flujo, etc.) con las diferentes especies de modo a ser un centro de referencia de informaciones para los interesados en realizar la cría de peces en cautiverio.
-Evaluar diferentes tipos de alimentos balanceados para peces en el laboratorio y estanques a fin de poder recomendar las raciones de acuerdo a la especie y tipo de producción que se desea realizar.
-Identificar los niveles adecuados de parámetros físico – químicos del agua de los estanques de experimentación.
-Desarrollar la tecnología de reproducción y cría de peces carnívoros (surubí, dorado).

• El proceso de reproducción artificial se realiza siguiendo los siguientes pasos:
-Captura de reproductores (padres).
-Adaptación a la vida en cautiverio.
-Inducción hormonal para lograr liberación de huevos y semen.
-Colecta de huevos de la hembra y fertilización con el semen del macho.
-Incubación de huevos y eclosión de larvas.
-Larvicultura y alevinaje.
-Entrega y siembra de alevines.

• Especies con las que se trabaja
-Piaractus mesopotamicus (Pacú).
-Leporinus sp (Boga).
-Prochilodus lineatus (Carimbatá o Sábalo).
-Rhamdia sp (Ñurundiá o bagre de arroyo).
-Pseudoplatysoma fasciatum (Surubí atigrado).
-Pseudoplatystoma coruscans (Surubí pintado).
-Salminus brasiliensis (Dorado).
-Brycon orbignianus (salmón del Paraná) experimental.

• Resultados
-Los alevines obtenidos son criados en los estanques, hasta que lleguen a un tamaño adecuado (5 a 10 cm) para que sean sembrados en los cuerpos de agua naturales o sean entregados a personas que desean realizar piscicultura en el área de influencia de Yacyretá.

-La EBY ha sembrado en el río y entregado a piscicultores más de 3.800.000 alevines de especies nativas, producidos en su estación de piscicultura.
-Capacitación a personas interesadas en realizar piscicultura.
-Se logró la reproducción de surubí (Pseudoplatystoma fasciatum) en sus dos especies atigrado y pintado desde el año 2012.

– Se ha logrado la reproducción artificial del dorado (Salminus brasiliensis).
-Se ha logrado la reproducción del Salmón del Paraná (Brycon orbignianus).

     2- Estación de Piscicultura de Ayolas

Desde el año 1998 hasta el año 2011 en la Estación de Piscicultura de Ayolas se realizaba la reproducción artificial de peces nativos del río Paraná.
A partir del año 2012 queda como centro de reproducción de especies exóticas especialmente la tilapia.

Capacidad de producción de 500.000 a 1.000.000 de alevines/año de tilapias revertidas que son entregadas a personas interesadas en la cría en cautiverio fomentando así la piscicultura de seguridad alimentaria y comercial de la zona.

     3- Monitoreo de la Fauna Íctica, experimental

Objetivo general
Generar información sobre la composición especifica de la ictiofauna del río Paraná, tramo comprendido entre Capitán Meza (Itapúa) y Panchito López (Misiones).

Metodología
Consiste en el estudio de las especies de peces que son capturadas con diferentes tipos de artes de pesca y en diferentes puntos de muestreo, para su posterior clasificación taxonómica, estudios de biometría, edad en peces, contenido estomacal, estado de madurez gonadal etc., de modo a determinar la composición especifica y tamaños de ejemplares de las poblaciones de peces del área de influencia de la represa de Yacyreta y su comportamiento en el tiempo.

Monitoreo de la fauna Ictica comercial y deportiva (encuestas).

Objetivo general
Evaluar el nivel de explotación de la Fauna Íctica en el área de influencia de Yacyretá, de modo a establecer stocks pesqueros y ayudar en establecer las políticas de explotación del recurso íctico.

Metodología
Se realiza mediante encuestas pesqueras a pescadores comerciales y deportivos que llegan a los puertos de muestreo.

     4- Laboratorio de Ictiología e ictiopatología

Objetivo general
Procesar las muestras que se obtienen del Monitoreo de la Fauna Íctica de modo a contar con estudios anexos de: edad en peces por estudio de otolitos, espinas y escamas, estudio de hábitos alimenticios por medio del contenido estomacal, establecimiento de potenciales lugares de desove por medio de estudio de huevos y larvas y también todo lo referente a diagnóstico de enfermedades parasitarias y micóticas en peces.

También se constituye en un laboratorio de ayuda para los piscicultores de la zona cuando lo demanden.